建筑垃圾綜合利用涉及的方面較廣，是一個不折不扣的系統工程，它需要全社會各行各業的積極參與。目前，重慶市在啟動建筑垃圾綜合利用的工作上面臨著許多難題亟需解決，包括有組織問題、技術問題、經濟問題和政策問題。

1、組織問題

建筑垃圾的資源化利用是一個系統工程，涉及大量的組織部門及社會層面。組織問題是解決好建筑垃圾綜合利用困難的好的步。在整個建筑垃圾綜合利用過程中，誰牽頭，誰主導，誰組織，誰協調，誰配合等等，我國還沒有比較成熟的管理理論。

2、技術問題

處理技術問題是包括重慶市在內的我國絕大多數城市在建筑垃圾處理方面最薄弱的地方。多數建筑垃圾通常都無法直接利用，需要在分揀、分類之后做一系列相應的技術處理工作之后才能保證再生材料的各項力學和物理性能。然而，目前重慶市的建筑垃圾資源化處理技術遠遠沒有普及，導致即使投產也無法被市場所接受。

3、經濟問題

除金屬、木材等小部分建筑廢料可通過廢品回收得到利用外，大多數的建筑垃圾只有經過回收加工處理后才會有新的利用價值，這期間都需要大量資金的投入。如果依照目前的處理技術水平來計算的話，建筑垃圾再生資源的制造成本明顯是高于使用新的天然原材料的。如何使建筑垃圾再生材料使用者可以有利所圖、提高企業使用的積極性，是重慶市政不得不慎重考慮的關鍵難題之一。

4、政策問題

目前，重慶市促進建筑垃圾綜合利用的政策法規才剛剛起步，已出臺的政策也沒有落實到位，且象征意義遠大于實際意義。如何加強建筑垃圾的組織、搜集和運輸等管理工作，如何鼓勵本地工程建設項目優先使用建筑垃圾再生建材，以及怎樣為建筑垃圾資源化生產用地和再生產品制定具有實效性的優惠政策等，這些都是重慶市政府應重視的政策問題。